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<languages /> | <languages /> | ||
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Le tableau présenté ci-dessous montre la liste des logiciels disponibles sur la plateforme nationale. Cette liste est modifiée à l'ajout de tout nouveau logiciel. Pour demander l'installation ou la mise à jour d'un logiciel ou d'une bibliothèque, communiquez avec le [[Technical support/fr|soutien technique]]. Pour utiliser notre environnement logiciel sur votre propre ordinateur, voyez [[accessing CVMFS/fr|la page wiki CVMFS]]. | Le tableau présenté ci-dessous montre la liste des logiciels disponibles sur la plateforme nationale. Cette liste est modifiée à l'ajout de tout nouveau logiciel. Pour demander l'installation ou la mise à jour d'un logiciel ou d'une bibliothèque, communiquez avec le [[Technical support/fr|soutien technique]]. Pour utiliser notre environnement logiciel sur votre propre ordinateur, voyez [[accessing CVMFS/fr|la page wiki CVMFS]]. | ||
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==Notes== | ==Notes== | ||
Pour utiliser un logiciel qui n'est pas déjà installé par défaut, vous devez charger le module qui s'applique. Pour plus d'information sur comment utiliser le système de modules Lmod, consultez [[ Utiliser des modules]]. Prenez note que certains modules prérequis sont chargés par défaut. | Pour utiliser un logiciel qui n'est pas déjà installé par défaut, vous devez charger le module qui s'applique. Pour plus d'information sur comment utiliser le système de modules Lmod, consultez [[ Utiliser des modules]]. Prenez note que certains modules prérequis sont chargés par défaut. | ||
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'''Points à retenir à propos des logiciels disponibles''' | '''Points à retenir à propos des logiciels disponibles''' | ||
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* Les paquets listés sont disponibles dans un ou plusieurs de nos environnements logiciels standards. Dans certains cas peu fréquents, vous devrez charger un environnement logiciel différent pour avoir accès à un paquet en particulier; voyez [[Standard software environments/fr|Environnements logiciels standards]]. | * Les paquets listés sont disponibles dans un ou plusieurs de nos environnements logiciels standards. Dans certains cas peu fréquents, vous devrez charger un environnement logiciel différent pour avoir accès à un paquet en particulier; voyez [[Standard software environments/fr|Environnements logiciels standards]]. | ||
* Plusieurs paquets reliés au système d’exploitation comme [[Autotools/fr|Autotools]], [[Make/fr|Make]] et [[Git]] ne sont pas installés en tant que modules, mais font partie de l'environnement par défaut; ils ne paraissent pas dans le tableau. | * Plusieurs paquets reliés au système d’exploitation comme [[Autotools/fr|Autotools]], [[Make/fr|Make]] et [[Git]] ne sont pas installés en tant que modules, mais font partie de l'environnement par défaut; ils ne paraissent pas dans le tableau. | ||
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=== Niagara === | === Niagara === | ||
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|module load StdEnv}} | |module load StdEnv}} | ||
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==Modules disponibles sur toutes les grappes== | ==Modules disponibles sur toutes les grappes== | ||
Le tableau suivant liste les logiciels pour lesquels un module d'environnement est disponible. Certains modules peuvent être chargés avec la commande <tt>module load</tt> alors que d'autres nécessitent des conditions particulières. | Le tableau suivant liste les logiciels pour lesquels un module d'environnement est disponible. Certains modules peuvent être chargés avec la commande <tt>module load</tt> alors que d'autres nécessitent des conditions particulières. | ||
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* tools (langages et bibliothèques) | * tools (langages et bibliothèques) | ||
* vis ([[Visualization/fr|visualisation]]). | * vis ([[Visualization/fr|visualisation]]). | ||
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<tabs> | <tabs> | ||
| Line 58: | Line 66: | ||
La plupart des applications sont installées dans CVMFS, un système de fichiers qui facilite la gestion du grand nombre des paquets que nous offrons. Cependant, d'autres paquets ne sont installés que dans certains sites, principalement pour des raisons de licence. | La plupart des applications sont installées dans CVMFS, un système de fichiers qui facilite la gestion du grand nombre des paquets que nous offrons. Cependant, d'autres paquets ne sont installés que dans certains sites, principalement pour des raisons de licence. | ||
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{| class="wikitable" | {| class="wikitable" | ||
|+ style="text-align: left;" |Logiciels installés localement | |+ style="text-align: left;" |Logiciels installés localement | ||
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| TPP/5.1.0 || bio || || Cedar || Trans-Proteomic Pipeline (TPP) est une collection d'outils intégrés développée au SPC pour l'analyse de données protéomiques MS/MS. Cedar offre aussi sur demande une interface web TPP (tpp_gui) par groupe. | | TPP/5.1.0 || bio || || Cedar || Trans-Proteomic Pipeline (TPP) est une collection d'outils intégrés développée au SPC pour l'analyse de données protéomiques MS/MS. Cedar offre aussi sur demande une interface web TPP (tpp_gui) par groupe. | ||
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