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Si l'installation d'un paquet échoue, portez attention au message d'erreur qui pourrait indiquer d'autres modules qui seraient requis. Pour plus d'information sur les commandes de <code>module</code>, consultez [[Utiliser des modules]]. | Si l'installation d'un paquet échoue, portez attention au message d'erreur qui pourrait indiquer d'autres modules qui seraient requis. Pour plus d'information sur les commandes de <code>module</code>, consultez [[Utiliser des modules]]. | ||
===Téléchargement de paquets=== | ===Téléchargement de paquets=== | ||
Si vous cherchez à installer un paquet que vous avez téléchargé, c'est-à-dire que vous n'avez pas utilisé <code>install.packages()</code>, vous pouvez l'installer comme suit. Par exemple, avec le paquet <tt>archive_package.tgz</tt>, vous exécuteriez la commande suivante dans l'interpréteur ( | Si vous cherchez à installer un paquet que vous avez téléchargé, c'est-à-dire que vous n'avez pas utilisé <code>install.packages()</code>, vous pouvez l'installer comme suit. Par exemple, avec le paquet <tt>archive_package.tgz</tt>, vous exécuteriez la commande suivante dans l'interpréteur (<i>shell</i>) | ||
{{Command | {{Command | ||
|R CMD INSTALL -l 'path for your local (home) R library' archive_package.tgz | |R CMD INSTALL -l 'path for your local (home) R library' archive_package.tgz | ||
}} | }} | ||
==Appels système== | ==Appels système== | ||
La commande R <code>system()</code> permet d'exécuter des commandes dans l'environnement actif, à l'intérieur de R; ceci risque de causer des problèmes sur nos grappes parce que R donne une valeur incorrecte à la variable d'environnement <code>LD_LIBRARY_PATH</code>. Utilisez plutôt la syntaxe <code>system("LD_LIBRARY_PATH=$RSNT_LD_LIBRARY_PATH <my system call>")</code> dans vos appels système. | |||
La commande R < | |||