35,879
edits
No edit summary |
(Updating to match new version of source page) |
||
Line 75: | Line 75: | ||
=== install.packages() === | === install.packages() === | ||
To install packages from [https://cran.r-project.org/ CRAN], you can use <code>install.packages</code> while running an interactive R session on a cluster login node. Since the compute nodes on most clusters do not have access to the Internet, installing R packages in a batch or interactive job is not possible. Many R packages are developed using the GNU family of compilers so we recommend that you load a <code>gcc</code> [[Utiliser des modules/en|module]] before trying to install any R packages. Use the same version of the <code>gcc</code> for all packages you install. | |||
{{Command | |||
|module load gcc/9.3.0 r/4.0.2 | |||
}} | |||
<div class="mw-translate-fuzzy"> | |||
Pour installer des paquets de [https://cran.r-project.org/ CRAN], vous pouvez utiliser la commande <code>install.packages</code> dans une session R interactive opérant sur le nœud de connexion. Comme plusieurs paquets R sont développés avec la famille de compilateurs [[GNU Parallel/fr|GNU]] nous recommandons de charger un [[Utiliser des modules|module]] <code>gcc</code> avant d'installer un paquet R. Utilisez la même version de <code>gcc</code> pour tous les paquets que vous installez. | Pour installer des paquets de [https://cran.r-project.org/ CRAN], vous pouvez utiliser la commande <code>install.packages</code> dans une session R interactive opérant sur le nœud de connexion. Comme plusieurs paquets R sont développés avec la famille de compilateurs [[GNU Parallel/fr|GNU]] nous recommandons de charger un [[Utiliser des modules|module]] <code>gcc</code> avant d'installer un paquet R. Utilisez la même version de <code>gcc</code> pour tous les paquets que vous installez. | ||
Line 82: | Line 88: | ||
==== Installation pour une version particulière de R ==== | ==== Installation pour une version particulière de R ==== | ||
Par exemple, pour installer le paquet <code>sp</code> qui offre des classes et des méthodes pour les données spatiales, utilisez cette commande sur un nœud de connexion. | Par exemple, pour installer le paquet <code>sp</code> qui offre des classes et des méthodes pour les données spatiales, utilisez cette commande sur un nœud de connexion. | ||
</div> | |||
{{Command | {{Command |