35,719
edits
Available software/fr: Difference between revisions
Jump to navigation
Jump to search
Updating to match new version of source page
No edit summary |
(Updating to match new version of source page) |
||
| Line 6: | Line 6: | ||
À l'exception des programmes de base des systèmes, l'accès à la plupart des logiciels se fait par le chargement de modules. Pour plus d'information sur comment utiliser le système de modules Lmod, consultez la page [[ Utiliser des modules]]. Prenez note que certains modules pré-requis sont chargés par défaut. | À l'exception des programmes de base des systèmes, l'accès à la plupart des logiciels se fait par le chargement de modules. Pour plus d'information sur comment utiliser le système de modules Lmod, consultez la page [[ Utiliser des modules]]. Prenez note que certains modules pré-requis sont chargés par défaut. | ||
<div class="mw-translate-fuzzy"> | |||
'''Points à retenir à propos des logiciels disponibles''' | '''Points à retenir à propos des logiciels disponibles''' | ||
| Line 16: | Line 17: | ||
* L'application de chimie [[Gaussian/fr|Gaussian]] est disponible sur Cedar et Graham, mais pas Niagara. | * L'application de chimie [[Gaussian/fr|Gaussian]] est disponible sur Cedar et Graham, mais pas Niagara. | ||
* Plusieurs paquets reliés au système d’exploitation comme [[Autotools/fr|Autotools]], [[Make/fr|Make]] et [[Git]] ne sont pas installés en tant que modules, mais font partie de l'environnement par défaut; ils ne paraissent pas dans le tableau. | * Plusieurs paquets reliés au système d’exploitation comme [[Autotools/fr|Autotools]], [[Make/fr|Make]] et [[Git]] ne sont pas installés en tant que modules, mais font partie de l'environnement par défaut; ils ne paraissent pas dans le tableau. | ||
</div> | |||
[[Niagara/fr|Niagara]] (LP) fait exception; les logiciels disponibles sur cette grappe sont énumérés dans le [[Niagara_Quickstart/fr#Charger_des_modules|Guide de démarrage pour Niagara]]. Vous pouvez toutefois accéder les modules listés ci-dessous en exécutant d'abord les commandes | [[Niagara/fr|Niagara]] (LP) fait exception; les logiciels disponibles sur cette grappe sont énumérés dans le [[Niagara_Quickstart/fr#Charger_des_modules|Guide de démarrage pour Niagara]]. Vous pouvez toutefois accéder les modules listés ci-dessous en exécutant d'abord les commandes | ||
| Line 22: | Line 24: | ||
<div class="mw-translate-fuzzy"> | |||
==Liste des modules== | ==Liste des modules== | ||
Le tableau suivant liste les logiciels pour lesquels un module d'environnement est disponible. Certains modules peuvent être chargés avec la commande <tt>module load</tt> alors que d'autres nécessitent des conditions particulières. | Le tableau suivant liste les logiciels pour lesquels un module d'environnement est disponible. Certains modules peuvent être chargés avec la commande <tt>module load</tt> alors que d'autres nécessitent des conditions particulières. | ||
| Line 39: | Line 42: | ||
* tools (langages et bibliothèques) | * tools (langages et bibliothèques) | ||
* vis ([[Visualization/fr|visualisation]]). | * vis ([[Visualization/fr|visualisation]]). | ||
</div> | |||
{{:Modules}} | {{:Modules}} | ||
== Site-specific software == | |||
Most application software is installed in CVMFS, a distributed file system which makes central management of the many packages easier. | |||
Certain packages, however, are not installed in CVMFS but are installed only at some sites, or are installed separately at each site. | |||
This is usually due to license restrictions on the package in question. | |||
Such packages are listed in the following table. | |||
{| class="wikitable" | |||
|+ style="text-align: left;" |List of software installed locally | |||
|- | |||
! scope="col" |Module !! scope="col" | Type !! scope="col" | Documentation !! scope="col" | Machines !! scope="col" | Description | |||
|- | |||
| adf || chem || [[ADF]] || graham || Amsterdam Density Functional Modeling Suite, computational chemistry software | |||
|- | |||
| dirac/16.0 ||rowspan="2"| phys ||rowspan="2"| ||rowspan="2"| cedar ||rowspan="2"| The DIRAC program computes molecular properties using relativistic quantum chemical methods. Homepage: http://diracprogram.org | |||
|- | |||
| dirac/17.0 | |||
|- | |||
| galaxy/17.09 || bio || || cedar || Galaxy is a scientific workflow, data integration, and data and analysis persistence and publishing platform that aims to make computational biology accessible to research scientists that do not have computer programming or systems administration experience. Any group on Cedar can have one Galaxy instance. The Galaxy instance will be run under a shared account which will be created by admins. Please contact support@computecanada.ca to set up Galaxy for you. Homepage: https://usegalaxy.org/ | |||
|- | |||
| gaussian/g03.d01 ||rowspan="5"| chem ||rowspan="5"| [[Gaussian]] ||rowspan="5"| cedar & graham ||rowspan="5"| Gaussian is a general purpose computational chemistry software package. Homepage: http://gaussian.com/ | |||
|- | |||
| gaussian/g09.b01 | |||
|- | |||
| gaussian/g09.e01 | |||
|- | |||
| gaussian/g09.a03 | |||
|- | |||
| gaussian/g09.b01 | |||
|- | |||
| gbrowse/2.56 || bio || [[GBrowse]] || cedar || GBrowse is a combination of database and interactive web pages for manipulating and displaying annotations on genomes. Homepage: http://gmod.org/wiki/GBrowse | |||
|- | |||
| sas/9.4 || math|| || cedar || SAS is a software suite developed by SAS Institute for advanced analytics, multivariate analyses, business intelligence, data management, and predictive analytics. SAS on cedar is licensed software and it belongs to users from the Alberta School of Business who are eligible to run SAS. Homepage: https://www.sas.com/en_ca/home.html | |||
|- | |||
| x2go/4.0.1.22 || vis || || cedar || X2Go is an open source remote desktop software for Linux that uses the NX technology protocol. On cedar we support only ICEVM window manager Homepage: https://wiki.x2go.org/doku.php | |||
|} | |||
==Logiciels sur les systèmes installés avant 2016== | ==Logiciels sur les systèmes installés avant 2016== | ||