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Utiliser des modules: Difference between revisions
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Nos serveurs peuvent exécuter la totalité des logiciels fonctionnant sous Linux. Dans le cas le plus simple, le logiciel dont vous avez besoin sera déjà installé sur l'un des serveurs de calcul. Il sera alors accessible sous la forme d'un '''module'''. Si ce n'est pas le cas, vous pouvez soit demander à notre équipe de l'installer pour vous, soit le faire vous-même. | |||
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Les modules sont des fichiers de configuration qui contiennent des instructions | Les modules sont des fichiers de configuration qui contiennent des instructions pour modifier votre environnement logiciel. Cette architecture modulaire permet d'avoir plusieurs versions d'une même application installées sans que celles-ci entrent en conflit. Pour les nouveaux serveurs, les modules sont gérés par l'outil [https://www.tacc.utexas.edu/research-development/tacc-projects/lmod Lmod], développé au [https://www.tacc.utexas.edu/ TACC]. Cet outil remplace [http://modules.sourceforge.net ''Environment Modules''], qui est utilisé sur la plupart des anciens serveurs. Si vous en êtes familier, vous ne devriez pas être trop dépaysé, car ''Lmod'' a été conçu pour être très similaire à ''Environment Modules''. Référez-vous alors à la section [[Utiliser des modules#Lmod_vs_Environment_Modules|Lmod vs Environment Modules]] ci-dessous pour connaître les différences principales. | ||
<!--T:3--> | <!--T:3--> | ||
Un fichier module ( | Un fichier module (''modulefile'') contient les informations nécessaires pour rendre disponible une application ou une bibliothèque dans la session de l'usager. Typiquement, un fichier module contient des instructions qui modifient ou initialisent les variables d'environnement comme <tt>PATH</tt> et <tt>LD_LIBRARY_PATH</tt> pour utiliser les différents logiciels installés. Notez que le simple fait de charger un module n'exécute pas le logiciel dont il est question. Pour connaître le nom du fichier binaire et la syntaxe de son usage il faut lire la documentation du logiciel et avec l'usage de la commande <tt>module</tt>, normalement vous n'avez pas besoin de connaître le chemin du logiciel ou de la bibliothèque. Vous pouvez pourtant voir des détails pour le module en tapant la commande <tt>module show <nom de module></tt>. | ||
= Principales commandes de <tt>module</tt> = <!--T:4--> | = Principales commandes de <tt>module</tt> = <!--T:4--> | ||
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<!--T:5--> | <!--T:5--> | ||
Pour connaître la liste des sous-commandes disponibles, | Pour connaître la liste des sous-commandes disponibles, utilisez | ||
{{Commande|module help}} | {{Commande|module help}} | ||
== Sous-commande <tt> | == Sous-commande <tt>spider</tt> (Lmod seulement) == <!--T:6--> | ||
La sous-commande <tt>spider</tt> fait afficher tous les modules qui se trouvent dans [[Standard software environment/fr|l'environnement logiciel standard]] courant. | |||
{{Commande|module | {{Commande|module spider}} | ||
<!--T:7--> | <!--T:7--> | ||
Si vous spécifiez le nom d'une application, par exemple avec | |||
{{Commande|module | {{Commande|module spider openmpi}} | ||
cela affichera la liste de toutes les versions disponibles. | |||
<!--T:8--> | <!--T:8--> | ||
Si vous spécifiez le nom de l'application avec son numéro de version, par exemple avec | |||
{{Commande|module spider openmpi/1.8.4}} | |||
cela vous affichera la liste des options de module à charger afin d'accéder à cette version. | |||
== Sous-commande <tt> | == Sous-commande <tt>avail</tt> == <!--T:9--> | ||
Pour lister les modules que vous pouvez charger, utilisez | |||
{{Commande|module | {{Commande|module avail}} | ||
<!--T:10--> | <!--T:10--> | ||
Vous pouvez obtenir une liste de modules disponibles pour une bibliothèque ou un outil particulier avec | |||
{{Commande|module | {{Commande|module avail openmpi}} | ||
<!--T:11--> | <!--T:11--> | ||
Notez que la commande <tt>module avail</tt> peut ne pas lister certains modules qui sont incompatibles avec les modules que vous avez chargés. Pour voir la liste des modules autres que ceux qui sont chargés et qui vous sont disponibles, utilisez la sous-commande <tt>spider</tt> documentée ci-dessus. | |||
== Sous-commande <tt>list</tt> == <!--T:12--> | == Sous-commande <tt>list</tt> == <!--T:12--> | ||