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La plupart des applications sont installées dans CVMFS, un système de fichiers qui facilite la gestion du grand nombre des paquets que nous offrons. Cependant, d'autres paquets ne sont installés que dans certains sites, principalement pour des raisons de licence. | La plupart des applications sont installées dans CVMFS, un système de fichiers qui facilite la gestion du grand nombre des paquets que nous offrons. Cependant, d'autres paquets ne sont installés que dans certains sites, principalement pour des raisons de licence. | ||
{| class="wikitable" | {| class="wikitable" | ||
|+ style="text-align: left;" | | |+ style="text-align: left;" |Logiciels installés localement | ||
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! scope="col" |Module !! scope="col" | Type !! scope="col" | Documentation !! scope="col" | | ! scope="col" |Module !! scope="col" | Type !! scope="col" | Documentation !! scope="col" | Grappe !! scope="col" | Description | ||
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| adf/2016.106 ||rowspan="6"| chem ||rowspan="6"| [[ADF]] ||rowspan="6"| | | adf/2016.106 ||rowspan="6"| chem ||rowspan="6"| [[ADF]] ||rowspan="6"| Graham ||rowspan="6"| Amsterdam Density Functional Modeling Suite; recherche en chimie computationnelle | ||
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| adf/2017.207 | | adf/2017.207 | ||
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| adf/2019.305 | | adf/2019.305 | ||
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| amber/16 || chem || [[AMBER]] || | | amber/16 || chem || [[AMBER]] || Graham || ensemble d'applications pour effectuer des simulations en dynamique moléculaire | ||
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| dirac/16.0 ||rowspan="2"| phys ||rowspan="2"| ||rowspan="2"| | | dirac/16.0 ||rowspan="2"| phys ||rowspan="2"| ||rowspan="2"| Cedar ||rowspan="2"| Direct Iterative Relativistic All-electron Calculations; calcule les propriétés moléculaires avec des méthodes de chimie quantique relativiste (site web : http://diracprogram.org) | ||
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| dirac/17.0 | | dirac/17.0 | ||
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| galaxy/17.09 || bio || || | | galaxy/17.09 || bio || || Cedar || plateforme d'analyse, de gestion et d'archivage des données qui rend la bio-informatique accessible aux chercheurs n'ayant pas de compétence en informatique. Sur Cedar, chaque groupe peut avoir une instance Galaxy qui est exécutée dans un compte partagé créé par une ou un administrateur de système; contactez le [support@computecanada.ca|soutien technique]. (site web : https://usegalaxy.org/) | ||
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| gaussian/g03.d01 ||rowspan="5"| chem ||rowspan="5"| [[Gaussian]] ||rowspan="5"| graham ||rowspan="5"| | | gaussian/g03.d01 ||rowspan="5"| chem ||rowspan="5"| [[Gaussian]] ||rowspan="5"| graham ||rowspan="5"| paquet logiciel d'usage général en chimie computationnelle (site web :http://gaussian.com/) | ||
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| gaussian/g09.e01 | | gaussian/g09.e01 | ||
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| gaussian/g16.c01 | | gaussian/g16.c01 | ||
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| gaussian/g03.d01 ||rowspan="6"| chem ||rowspan="6"| [[Gaussian]] ||rowspan="6"| cedar ||rowspan="6"| | | gaussian/g03.d01 ||rowspan="6"| chem ||rowspan="6"| [[Gaussian]] ||rowspan="6"| cedar ||rowspan="6"| paquet logiciel d'usage général en chimie computationnelle (site web :http://gaussian.com/) | ||
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| gaussian/g09.b01 | | gaussian/g09.b01 | ||
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| gaussian/g16.c01 | | gaussian/g16.c01 | ||
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| gbrowse/2.56 || bio || [[GBrowse]] || | | gbrowse/2.56 || bio || [[GBrowse]] || Cedar || outil composé d’une base de données combinée à des pages web interactives pour manipuler et visualiser des données génomiques (site web :http://gmod.org/wiki/GBrowse) | ||
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| sas/9.4 || math|| || | | sas/9.4 || math|| || Cedar || SAS is a software suite developed by SAS Institute for advanced analytics, multivariate analyses, business intelligence, data management, and predictive analytics. SAS on cedar is licensed software and it belongs to users from the Alberta School of Business who are eligible to run SAS. 9site web :https://www.sas.com/en_ca/home.html0 | ||
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| x2go/4.0.1.22 || vis || || | | x2go/4.0.1.22 || vis || || Cedar || X2Go is an open source remote desktop software for Linux that uses the NX technology protocol. On cedar we support only ICEVM window manager (site web :https://wiki.x2go.org/doku.php) | ||
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